Ma'ayan Lab - GEO2Enrichr
Ma'ayan Lab is een hulpmiddel voor de extractie en analyse van differentieel tot expressie gebrachte genen uit genexpressiegegevens die zijn verzameld in de Gene Expression Omnibus (GEO)-repository. Een functie genaamd GEO2Enrichr stelt onderzoekers in staat om snel hypothesen te onderzoeken zonder technische overhead, waardoor de toegangsdrempel voor biologen wordt verlaagd door de gegevensverwerkingsstappen te automatiseren die nodig zijn voor kennisextractie uit de grote repository GEO.
GEO2Enrichr biedt een interactieve interface voor het uploaden, verwerken en analyseren van twee groepen monsters. De ene groep is nodig voor de analyse en de andere voor het uploaden en verwerken van de bestanden.
Nadat ze zijn geüpload, maakt de server een lijst met differentieel tot expressie gebrachte genen en stuurt deze naar Enrichr voor verdere functionele analyse.
